Le CIMS conçoit et développe des applications informatiques au profit des établissements qui dépendent du Ministère de la Santé .
Comme la stratégie du CIMS en matière d’applications informatiques est axée sur l’utilisation de systèmes ouverts et portables, le choix du centre a porté sur le système d’exploitation UNIX et sur le SGBDR ORACLE.
Parmi les applications informatiques réalisées par le CIMS au profit des hôpitaux, on peut notamment citer celles qui ont pour objet :